中國鐵路經(jīng)濟規劃研究院有限公司于2013年4月1日系由鐵道部經(jīng)濟規劃研究院（鐵道部工程設計鑒定中心）事業(yè)法人整體轉為企業(yè)法人，2015年2月2日完成工商注冊登記，2018年3月19日變更為“中國鐵路經(jīng)濟規劃研究院有限公司”。

鐵道部經(jīng)濟規劃研究院（鐵道部工程設計鑒定中心）合并重組于2002年1月，是在原鐵道部工程設計鑒定中心、原鐵道部經(jīng)濟規劃研究院、原鐵路工程技術(shù)標準所和原鐵路工程定額所（2004年8月并入）四個(gè)單位基礎上組建而來(lái)。2008年，為加快鐵路客站建設，設立內設機構鐵路客站管理部；2010年，原鐵道部設立鐵路客站建設總指揮部，掛靠經(jīng)規院，2012年，為適應鐵路改革需要，該機構整體劃入原鐵道部工管中心。其中：
1. 原鐵道部工程設計鑒定中心。

前身是1953年鐵道部為統一設計技術(shù)標準增設的技術(shù)鑒定委員會(huì )，1955年12月更名為鐵道部設計預算鑒定委員會(huì )，是鐵道部機關(guān)的組成部分。經(jīng)歷十年文化大革命以后，1978年6月，鐵道部重新成立設計預算鑒定委員會(huì )，主要負責審查新建鐵路干線(xiàn)、復線(xiàn)、支線(xiàn)、樞紐、電氣化鐵路、獨立特大橋、大型客站站房及基建投資在一千五百萬(wàn)元以上的舊線(xiàn)、樞紐技術(shù)改造的初步設計（包括概算）。1989年7月，鐵道部建設司成立，設計鑒定委員會(huì )被撤銷(xiāo)，其工作納入建設司設計鑒定處。1994年6月，為適應鐵路發(fā)展，進(jìn)一步加強鐵路工程設計鑒定工作，鐵道部決定成立鐵道部工程設計鑒定中心，作為部直屬事業(yè)單位，受部委托承擔部管鐵路大中型建設項目的設計及概算的審查鑒定工作。2002年1月1日，并入重組后的鐵道部經(jīng)濟規劃研究院。
2. 原鐵道部經(jīng)濟規劃研究院。

前身是1974年成立的交通部規劃院，1978年鐵道部與交通部分立時(shí)成立了鐵道部規劃院，開(kāi)展鐵路規劃專(zhuān)項研究工作。1991年2月，鐵道部規劃院與鐵道部科學(xué)研究院運輸與經(jīng)濟研究所的管理經(jīng)濟和經(jīng)濟體制改革兩個(gè)研究室合并，成立了原鐵道部經(jīng)濟規劃研究院，基本職責是：為鐵路發(fā)展戰略、方針和目標提供科學(xué)依據；為制訂鐵路宏觀(guān)經(jīng)濟管理的方針、政策與基本體制、制度提出建議；為編制鐵路中長(cháng)期規劃與進(jìn)行重大項目建設提出建議方案；在鐵路軟科學(xué)和對外交流方面發(fā)揮重要作用。2002年1月1日，并入重組后的鐵道部經(jīng)濟規劃研究院。
3. 原鐵路工程技術(shù)標準所。

前身是1983年成立的鐵道部專(zhuān)業(yè)設計院規范處，主要負責鐵路工程建設標準，工務(wù)工程、電力照明、修車(chē)設備產(chǎn)品標準，標準設計，基建科研四方面管理工作，業(yè)務(wù)受原鐵道部基建總局領(lǐng)導。1990年1月1日，鐵道部專(zhuān)業(yè)設計院規范處更名為鐵道部建設司標準科情所，行政工作由鐵道部專(zhuān)業(yè)設計院代管，業(yè)務(wù)工作受鐵道部建設司直接領(lǐng)導。除負責工程建設標準、三個(gè)專(zhuān)業(yè)產(chǎn)品標準、標準設計、基建科研四方面管理工作之外，還承擔鐵道部下屬10余個(gè)基建情報網(wǎng)的管理工作。1998年1月1日，建設司標準科情所更名為鐵路工程技術(shù)標準所，行政工作仍由鐵道部專(zhuān)業(yè)設計院管理，業(yè)務(wù)工作受鐵道部建設司指導，主要負責工程建設標準、三個(gè)專(zhuān)業(yè)產(chǎn)品標準、標準設計三方面管理工作。2002年1月1日，并入重組后的鐵道部經(jīng)濟規劃研究院。
4. 原鐵路工程定額所。

其前身是1984年6月成立的鐵道部基建總局概算預算定額管理所，由鐵三院代管。1989年9月更名為鐵道部建設司工程定額所，行政工作由鐵三院代管，業(yè)務(wù)工作受鐵道部建設司指導。1998年12月改名為鐵路工程定額所，業(yè)務(wù)工作受建設司領(lǐng)導，機構設置和人員編制由所在單位確定。2003年10月改由鐵道部經(jīng)濟規劃研究院代管，業(yè)務(wù)工作由鐵道部建設司指導。2004年8月并入重組后的鐵道部經(jīng)濟規劃研究院，2006年變更為獨立事業(yè)單位法人機構。